Geometry description and mesh construction from medical imaging^∗

¹ INRIA, Bordeaux Sud-Ouest, France
² IMB, Université de Bordeaux, France
³ IRMA, Université de Strasbourg, France
⁴ Laboratoire IMATH (EA 2134), Université de Toulon, France
⁵ CNR, IMATI “E. Magenes”, Italy

Abstract

We present a new method for defining and meshing patient-specific domains from medical images. Our approach is based on an atlas image segmentation technique, and relies on the modular registration algorithm of S. Bertoluzza et al. [25]. The mesh of the patient-specific domain is generated by deforming the corresponding mesh on an a priori segmented and meshed reference image (the atlas). Our method aims at automating the process at the interface of medical imaging and numerical simulation, thus reducing the computational cost in those situations where simulations have to be managed on numerous medical images of similar patients.

Résumé

Nous présentons une nouvelle méthode de reconnaissance et de maillage d’un domaine d’intérêt d’une image médicale. Notre approche se base sur une méthode de segmentation à partir d’un atlas, et dépend de la boîte à outils modulaire pour la co-registration d’images développée par S. Bertoluzza et al. [25]. Le maillage du domaine spécifique au patient est généré par déformation du maillage correspondant sur une image de référence segmentée a priori (l’atlas). Notre méthode vise à automatiser le processus à l’interface entre l’imagerie médicale et la simulation numérique, avec pour but de réduire le c0ût de calcul dans les situations dans lesquelles des simulations doivent être faites sur de nombreuses images similaires.